腸道的疾病可分為內科及外科兩方面。腸炎是很常見的內科疾病，幾乎每個人都有腸炎的經驗。大部份的腸炎是病毒引起的，例如輪狀病毒。有些腸炎是細菌引起的，例如喝了不潔的水或污染的食物，像沙門氏菌等可以引起嚴重的症狀。
除了因感染引起的問題外，嬰幼兒還可能發生其他腸道問題，例如新生兒壞死性腸災、腸道閉鎖及狹窄等，因這些多是新生兒的問題，通常出生後不久就被發現及治療了。下列問題可能出現在較大的嬰幼兒，家長們應要有一定的認識。
1. 腸套疊
這疾病好發於六個月到一歲半的兒童。腸套疊是一段腸子套進另一段的腸子內。引起腸套疊的原因通常是腸蠕動不正常，其誘發因素包括病毒感染及食物的改變，有時腸內有息肉或腫瘤也會引起腸套疊。
腸套疊的症狀是腹痛，其特點是一陣陣的發作絞痛。常在一陣腹痛後，症狀消失，然後又再發作。發生時間較久後，小朋友會出現嘔吐的症狀。如沒有治療，幾小時後還可能會解出血便、腹漲等。因為無法進食、嘔吐，病人漸漸會有脫水、休克等更嚴重的情形。腸道如套疊太緊，就會發生血液循環受阻的情形，時間久了腸道會就壞死、穿孔，甚至出現腹膜炎。
腸套疊的診斷可由患者的症狀及年齡而高度懷疑，常用的診斷工具是腹部超音波及下消化道攝影。腹部超音波因為安全而且可以同時檢查腹內其他器官，所以是優先的選擇。下消化道攝影又稱為鋇劑灌腸攝影，是用鋇劑當作顯影劑，從肛門灌入大腸，再用放射線觀察大腸內的情形。
腸套疊的治療有灌腸及手術兩種。灌腸適用於症狀發生不久、病情不太嚴重的情形，其方法是在超音波或放射線監看下，用水或鋇劑灌入大腸，利用壓力把套入的大腸推回原位。如果症狀已發生太久、可能腸道已壞死、有腹膜炎的現象或灌腸治療失敗等，就要用外科手術治療了。
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| 腸套疊 |
巨結腸症如發生在兒童是因為腸道缺乏神經節，是一種先天性的疾病。缺少了正常神經功能，受影響的腸道會經常處在收縮的狀態，無法正常蠕動。最常受影響的腸道是下段的大腸，也就是所謂乙狀結腸及直腸。
此症以便秘為主要症狀，新生兒的胎便可能會延遲排出。便秘會引起腹漲，也會造成腸炎，所以巨結腸症的小朋友肚子常是大大的，也常有腹瀉的情形。有時好幾天不排便，但接著幾天會拉肚子，解出很臭、灰褐色、大量的水便，還常有發燒現象。腸炎引起的脫水及細菌感染會使病情變得危急。
巨結腸症可由病史及症狀得到初步診斷，加上放射線檢查、直腸切片，還可藉由測量肛門壓力來確定。此症之手術前治療可用大腸灌洗及用藥等，減少腸炎的發生，但根本治療仍須由外科手術切除患病的腸段。
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| 巨結腸症 |
3. 梅克氏憩室
梅克氏憩室是在小腸旁有一段的凸出，是一種頗為常見的異常，但大部份有此憩室的人不會有任何症狀。部份的憩室因有胃或胰組織，會造成潰瘍或出血，也可能會發炎，所以症狀是血便或腹痛。此症有時不容易診斷，但超音波及核子醫學檢查可以幫忙。治療的方法是外科切除。
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| 梅克氏憩室 |
3. 腸息肉
息肉可以出現在小腸或大腸內，其症狀是經常腹痛，也可能會有便血的情形。腸息肉也可能引起腸套疊。有些腸息肉是有家族性的，也有部份可能會有惡性變化。腸息肉的診斷視發生的位置，可能需要內視鏡、腸道攝影及超音波等檢查。此症的治療是手術切除。
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| 腸息肉 |
不同的腸道問題引起的症狀有時是相似的，常有誤診的可能，因此要及早得到正確的診斷及治療，有賴專業醫師及必要的檢查。
